霍尔木兹海峡
这是停火协议的关键前提，也是双方分歧最直接的议题。美国要求“全面、立即、安全”开放海峡，伊朗则坚持通航须与本国武装部队协调。停火后伊朗已两度收紧通行管制，并据报要求对过往油轮征收每桶1美元通航费。分析认为，美国若接受伊朗对海峡的任何控制权，将构成“战略失败”。
伊朗浓缩铀
双方在此问题上各划红线、毫无交集。美方要求伊朗完全放弃浓缩铀，称此为“不会退让的底线”。伊朗则坚持保留一定程度的铀浓缩活动。技术层面，专家指出已深埋地下的核设施若不动用地面部队，实际上难以强行清除。
黎巴嫩真主党
此问题牵涉美国能否有效制约以色列。伊朗坚持黎巴嫩必须纳入停火协议，但以色列在美伊宣布停火后随即对黎巴嫩发动大规模空袭。美国随后称停火不涵盖黎巴嫩。分析指出，若“以色列变量”无法妥善处理，停火稳定性将持续受到侵蚀。
白宫前伊朗问题特使马利指出，此次停火是在双方均未作实质性让步的情况下仓促达成的，谈判基础极为脆弱。
